其次，認定標準不同。高新技術企業是省級科技主管部門進行百分制的評審，然后到火炬中心備案，認定門檻高，行業特征不明顯。軟件企業只需省級部門審批就行，準入門檻低，行業特色鮮明。

       第三，優惠政策不同。高新技術企業除了有所得稅的減免征收外，在北京還能享受高級人才戶口進京的優惠政策。而軟件企業對于小規模納稅人來講只有所得稅的優惠政策，且周期較短。

       第四，復審制度不同。高新技術企業的資質是三年復審，六年重審。軟件企業是每年都要年檢。